《在“不忘初心、牢记使命”主题教育中集中整顿软弱涣散基层党组织实施方案》明确，全国性社会组织由中央和国家机关工委、国务院国资委党委分头负责。在第二批主题教育中，中央和国家机关工委把整顿软弱涣散党组织工作作为主题教育的重点工作和重要抓手，明确由一个巡回指导组专门负责社会组织软弱涣散党组织整顿工作。工作开展以来，巡回指导组始终坚持问题导向，加大整治力度，高标准、严要求推进整顿工作，真正使主题教育成为推动社会组织党组织全面进步的生动实践，取得初步成效。

精确定位，开出“方子”。针对摸排掌握的情况，对各部门填报的情况逐一“过筛子”，查实找准存在问题及“病灶”，共同研究开出具体“药方”：对覆盖单位超过5个，党组织活动开展较为困难的联合党支部及覆盖单位均为规模小的社会组织且党组织活动不经常的联合党支部，要求及时调整支部设置。对班子配备不齐的党组织，要求尽快配齐党组织班子，确实有困难的要作出工作方案，明确工作进度。对班子严重内耗甚至出现违纪违法案件的党组织，要求及时推进换届工作或作出负责人调整。对个别社会组织没有业务主管单位的，暂由巡回指导组先把工作做起来，并逐步明确业务主管归属。对摸排中发现的5年以上未年检的“僵尸社会组织”，推动民政部门和业务主管单位启动撤销或注销程序。